高通量测序技术在亲子鉴定中的应用

2025-05-08
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  高通量测序(NGS)技术通过大规模并行测序,能够在一次运行中获取数万至数百万个遗传位点的信息,为复杂或降解样本的亲子鉴定提供了全新的解决方案。


一、技术原理与特点


  NGS基于文库构建后,将待测DNA片段载入测序平台,通过边合成边测序方式同时获取大量短序列读段(reads),再进行生物信息学拼接与比对,以识别父母与子女在单核苷酸多态性(SNP)、微卫星(STR)等位点上的遗传一致性。


  该技术的核心优势在于:
  - 通量高:一次运行可覆盖上万至上百万个位点,远超传统PCR-STR多重扩增的15–20个位点。
  - 样本适应性强:对降解或混合样本具有更高的信号获取能力,可处理司法现场遗留的复杂样本。
  - 数据丰富:除常规STR/SNP外,还能兼顾线粒体DNA和Y染色体标记,为特殊亲缘关系(如骨髓移植、同卵双胞胎)提供更多分析维度。


二、实验流程概述


1. 样本采集与DNA提取

  采集血液、口腔拭子或其他合规生物样本后,使用磁珠法或柱式试剂盒提取DNA,并通过荧光染料法或分光光度计评估浓度与纯度。

2. 文库构建与质控

  将多重PCR扩增的片段或全基因组片段进行文库构建,采用实时定量PCR及毛细管电泳/Agilent 2100系统进行文库质量检测,确保文库浓度和片段分布符合测序要求。

3. 上机测序

  常用平台包括Illumina系列(MiSeq、NextSeq)和MGI/BGI系列,高通量可同时处理数十至数百个样本,单次运行可在12–48小时内完成数据产出。

4. 数据分析

  通过生物信息学流程(比对、变异检测和基因型判定),提取目标STR/SNP位点信息,计算单个位点亲权指数(PI)并乘积得到综合亲权概率(CPI),完成血缘关系判定。


三、主要应用场景


  1. 无创产前亲子鉴定:利用孕妇血浆中游离胎儿DNA进行血缘分析,实现孕早期(≥10周)安全检测,准确率可达99.99%。
  2. 司法现场取证:对骨折遗骸、烟头、牙刷等复杂或微量样本进行身份确认与亲缘比对,为刑事侦查提供关键证据。
  3. 混合与降解样本分析:在传统STR检测困难时,NGS可利用深度测序数据从背景噪声中提取目标信息,确保鉴定准确。


四、优势与挑战


  - 优势:高通量、多标记、适应复杂样本、自动化程度高;

  - 挑战:成本相对STR略高、数据处理复杂度大、对实验室信息化与生信能力要求高。


五、质量控制与合规要求


  1. 机构资质:必须持有《司法鉴定许可证》并通过CNAS或ISO 17025认可;
  2. 全程留痕:采样、运输、上机测序及数据分析环节均需录像或日志记录,确保样本链完整;
  3. 数据安全:基因组数据为敏感信息,需实施分级权限、加密存储与定期销毁制度。


六、小结

  高通量测序技术以其优异的通量和适应性,正成为亲子鉴定领域的前沿方案。依托三甲医院基因诊断中心的专业平台和司法资质,可为各类血缘关系鉴定提供科学、精准且高效的一站式服务。